绪论

第一章 果树季节性休眠的分子机制

1生长停止和休眠诱导

1.1 DAM相关基因

1.2 DAM基因抑制了FT基因的表达

1.3光受体PHY和生物钟基因在休眠诱导中的作用

2自然休眠过程中植株的生命活动

2.1 CBF转录因子参与的休眠期间耐冷机制

2.2 Lea蛋白相关基因的表达

2.3热激蛋白

3休眠解除

3.1 GH17基因家族参与了休眠解除

3.2质子泵和热激蛋白的作用

3.3过氧化氢等抗氧化系统也参与了休眠解除

4信号转导网络在休眠中的作用

4.1 Ca信号物质在休眠解除中的作用

4.2植物激素、过氧化氢和锌指家族基因的信号作用

5展望

第二章 果树砧穗间相互作用的分子机制

1果树砧穗间相互作用的传统机制

2果树砧穗间基因表达差异分析

3植物砧穗间生物大分子的运输

3.1植物体运输系统

3.2 RNA植物体韧皮部长距离运输机制

3.3植物体韧皮部长距离运输的分子

4 RNA植物体韧皮部长距离运输调控砧木或接穗性状

4.1砧木RNA韧皮部长距离运输调控接穗性状

4.2接穗RNA韧皮部长距离运输调控砧木性状

5展望

5.1砧穗间韧皮部长距离运输的差异性RNA表达分析

5.2韧皮部长距离运输的RNA分子在果树转基因中的应用

第三章 果树开花的分子生物学基础

1童期的调控

2开花时间的调控

3花器官形成和发育的调控

3.1花分生组织特征基因激活花器官特征基因

3.2雌蕊的形成和发育的分子机制

3.3 miRNA在果树花形成和发育中的调控作用

4展望

第四章 果树自交不亲和性的分子机制

1雌蕊特异性决定因子

1.1 S糖蛋白（S-RNase）的发现

1.2 S-RNase基因的结构特征

1.3 S-RNase基因的内含子

2雄蕊特异性决定因子

2.1 S位点的连锁基因

2.2李属果树植物的雄蕊特异性决定因子

2.3梨属和苹果属植物的雄蕊特异性决定因子

3蔷薇科果树自交（不）亲和性机制

3.1雌蕊S基因的变异

3.2花粉S基因的变异

3.3“竞争作用”模式

3.4无功能的雌蕊和花粉S基因的积累

4植物自交不亲和性的反应模式

4.1受体模式和抑制模式学说

4.2简单抑制模式

4.3修正抑制模式

5修饰基因

5.1 HT-B基因

5.2 PhSBP1基因

5.3其他修饰基因

6蔷薇科果树S等位基因的进化

6.1 S-R Na se基因的进化学说

6.2李属植物SFB/SLF基因的进化

6.3李属新特异性S基因的进化模式

7花粉管在花柱中的生长调控机制

第五章 果实糖、酸积累的分子基础

1果实糖分积累

1.1糖分运输

1.2果实糖分分配

1.3糖分在液泡中积累

2果实酸积累

2.1有机酸代谢相关酶的基因表达与有机酸积累

2.2有机酸的运输蛋白与酸积累

3果实糖、酸研究展望

第六章 果实色泽发育的分子基础

1花青苷合成

1.1花青苷的生物合成途径

1.2影响花青苷合成的环境因子

1.3转录因子

1.4果树的花青苷合成和转录调控

2植物类胡萝卜素代谢

2.1植物类胡萝卜素代谢途径

2.2植物类胡萝卜素代谢调控

2.3番茄果实类胡萝卜素代谢研究

2.4柑橘果实类胡萝卜素代谢研究

第七章 水果过敏及过敏原的分子基础

1水果过敏简要背景知识

1.1水果过敏的临床表现和流行病学调查

1.2水果过敏反应发生机制

1.3水果过敏与花粉等过敏的交叉反应

2主要水果过敏蛋白家族分类和特性

2.1过敏原的鉴定与命名

2.2水果过敏原蛋白家族聚类

2.3过敏原结构及与抗体结合表位鉴定

3过敏原基因图谱定位和基因组序列分布

3.1过敏原基因连锁图谱定位

3.2基因组序列物理图谱

4过敏原基因表达

5品种间过敏性的差异

5.1不同品种过敏性评价

5.2苹果Ma l d 1基因成员遗传多样性和与过敏性关联分析

6展望

第八章 乙烯和脱落酸对果实成熟与衰老的分子调控机制

1乙烯与果实成熟和衰老的关系

1.1乙烯的生物合成

1.2乙烯的信号转导

2脱落酸与果实成熟的关系

2.1高等植物ABA的生物合成

2.2 ABA的分解代谢

2.3高等植物ABA的信号转导途径

第九章 果实成熟质地变化的调控机制

1成熟果实质地变化的生物学特征

1.1果实软化

1.2果实木质化

2与果实质地相关的酶活性及基因表达

2.1乙烯生物合成与信号转导

2.2细胞壁降解相关酶

2.3细胞壁次生木质化相关酶

2.4膨胀素蛋白

3果实成熟衰老质地变化的调控

3.1物理调控

3.2生物化学调控

4展望

第十章 果树铁素代谢的分子基础

1果树对铁素的吸收

1.1外界环境对果树吸收铁素的影响

1.2铁吸收相关的基因

1.3植物激素对铁吸收的影响

1.4与铁吸收相关转录因子的调控

1.5植物缺铁胁迫下诱导蛋白的研究

1.6苹果吸收利用铁素的分子机制

2铁素在植物体内的运输

2.1铁的长距离运输

2.2细胞内的铁运输

3铁的储存和利用

3.1铁的储存

3.2铁的利用

4展望

第十一章 果树抗病的分子机制

1植物抗病的分子基础

1.1寄主-病原物互作

1.2植物抗病反应机制

1.3果树抗病的分子机制

1.4植物抗病基因

2果树抗病基因研究进展

2.1葡萄抗病基因研究进展

2.2苹果抗病基因研究

2.3柑橘抗病基因研究进展

3展望

第十二章 果树响应温度胁迫的分子机制

1低温胁迫

1.1耐低温的分子机制

1.2低温胁迫下的信号转导和基因表达

1.3低温信号转导

2高温胁迫

2.1热激蛋白

2.2热激转录因子

2.3高温胁迫的信号转导机制

第十三章 果树响应水分胁迫的分子机制

1植物水分胁迫信号传递的一般过程

2植物水分胁迫信号识别与转导途径

2.1根系对土壤干旱的识别与感知

2.2植物水分胁迫信号转导途径

3介导水分胁迫信号的胞内信使

3.1钙离子

3.2一氧化氮

3.3多胺

4水分胁迫下胞间信使ABA的产生

5水分胁迫信号传递中的蛋白可逆磷酸化

5.1胁迫下的蛋白磷酸化与去磷酸化

5.2 CDPK

5.3 MAPK

5.4 PP2C和SnRK2

6响应水分胁迫的转录因子

6.1 AP2/EREBP类转录因子

6.2 bZIP类转录因子

6.3 MYB类转录因子

6.4 NAC转录因子

6.5 WRKY转录因子

7与水分胁迫相关的功能基因

7.1渗透调节物质合成基因

7.2 LEA基因

7.3水孔蛋白基因

7.4活性氧清除酶基因

8展望

第十四章 果树耐盐的分子机制

1盐胁迫应答基因

1.1渗透调节物质合成基因

1.2离子转运和重建离子平衡的有关基因

1.3编码抗逆相关蛋白的基因

2调节基因

2.1 bZIP类转录因子

2.2 HD-ZIP转录因子

2.3 AP2/EREBP类转录因子

2.4 MYB转录因子

2.5 NAC转录因子

3小RNA与植物抗盐性

4盐胁迫信号的感知与传导

4.1 SOS信号转导途径

4.2 CDPK级联反应途径

4.3 MAPK级联反应途径

4.4 ABA信号通路

第十五章miRNA在果树发育中的作用

1 miRNA概述

1.1 miRNA的发现

1.2 miRNA的生物合成

1.3 miRNA的作用机制

1.4植物miRNA的特点

1.5植物miRNA的功能

1.6 miRbase数据库

2 miRNA的分离和鉴定方法

2.1遗传学筛选法

2.2小分子RNA克隆

2.3生物信息学预测法

2.4高通量测序

2.5 Northern杂交

2.6原位杂交

2.7基因芯片

2.8反转录聚合酶链式反应

2.9 miR-RACE克隆法

3果树中miRNA的鉴定和功能研究

3.1果树miRNA生物信息学预测

3.2果树miRNA的鉴定

3.3果树miRNA高通量测序

3.4果树miRNA靶基因鉴定

4展望

第十六章 逆转座子在果树遗传进化和发育中的作用

1植物逆转座子的类型和结构

2逆转座子的转座和转录

2.1逆转座子的转座过程

2.2逆转座子转录活性的调控

2.3逆转座子的沉默

3逆转座子在果树遗传进化中的作用

3.1基因组中的逆转座子数量和分布

3.2逆转座子在果树遗传进化中的作用

4逆转座子在果树发育中的作用

5逆转座子的研究工具和技术

5.1基于逆转座子的分子标记及其应用

5.2逆转座子在植物功能基因组学中的应用

6展望

第十七章 果树基因工程

1转基因技术与方法

1.1农杆菌介导法

1.2基因枪法

1.3电穿孔法

1.4花粉管通道法

2果树转基因进展

2.1促进果树生根和树体矮化

2.2缩短果树童期和早花早实

2.3提高果树抗病性

2.4提高果树抗虫害能力

2.5提高果树抗非生物逆境的能力

2.6提高果品耐储运能力

2.7改善果实品质

2.8其他

3展望

3.1果树功能基因有待进一步挖掘

3.2转基因果树安全性

3.3高效遗传转化体系

3.4多基因转化

3.5商业化应用