1 生物芯片技术简介 陈忠斌 王艳华 译

1.1 引言

1.2 DNA微阵列芯片的发展过程

1.3 DNA微阵列和基因芯片

1.4 基于启动子的DNA微阵列芯片

1.5 生物芯片操作中遇到的问题

1.6 芯片检测方法

参考文献

1.7 结论

2 微阵列生物芯片操作的实验室自动化 马卓娅 汤华 译

2.1 为什么要实现实验室的自动化操作？

2.2 定制微阵列芯片的制作

2.3 杂交系统的自动化

2.4 芯片数据的读取——扫描仪

2.5 实验室的常规自动化

2.6 总结

参考文献

3 DNA芯片与生物芯片中心实验室 刘全俊 潘品良 译

3.1 引言

3.2 点样芯片——寡核苷酸或PCR扩增子？

3.3 DNA的高通量扩增

3.4 小鼠单基因微阵列的制备

3.5 RNA的确定和荧光靶标的标记

3.6 标记靶标的评价

3.7 微阵列芯片的预扫描

3.8 杂交和扫描

3.9 点制芯片的质量控制

3.10 芯片点样仪和扫描仪

3.11 数据分析——克隆跟踪、芯片寻点（spotfinding）以及数据发掘

3.12 结论

参考文献

4 生物芯片的纳米颗粒标记 刘全俊 陆祖宏 潘品良 译

4.1 引言

4.2 RLS粒子作为超灵敏检测标记物的基本原理

4.3 光散射理论和选择便于超灵敏检测的颗粒大小组分

4.4 仪器

4.6 RLS颗粒在固相检测分析中的检测灵敏度和检测范围

4.5 蛋白质、DNA探针及配体与RSL颗粒的交联

4.7 应用

致谢

参考文献

5 如何评估生物芯片扫描仪 潘品良 刘全俊 译

5.1 引言

5.2 扫描仪的校准

5.3 总结

参考文献

6 全基因组水平mRNA表达谱分析在农业基因组学研究中的应用 周鑫 徐文英 译

6.1 引言

6.2 基因转录谱分析芯片

6.3 对未测序植物的可选方法

6.4 农业研究中的应用范围

6.5 整合互补的基因组数据

6.6 结论

参考文献

7 生物芯片技术在药物靶标确证和新药发现中的应用 文思远 王升启 译

7.1 基因组学和药物发现

7.2 单核苷酸多态性和Crohn病

7.3 微阵列技术和精神分裂症

参考文献

8 蛋白质芯片在蛋白质组学中的应用 周华蕾 马玉媛 吕茂民 译 章金刚 校

8.1 引言

8.2 芯片构造与表面化学

8.3 结合蛋白的检测

8.4 蛋白质芯片的应用

致谢

8.5 结论

参考文献

9 SpanscriptTM：快速获取非冗余cDNA3'端文库用于制备微阵列芯片的方法 仇华吉 刘丽玲 译

9.1 引言

9.2 Spanscript方法学

9.3 用于微阵列芯片的3'cDNA文库（探针库）制备

9.4 Spanscript技术应用实例

9.5 基本原理

9.6 Spanscript软件

9.7 讨论

参考文献

10 生物芯片数据管理 陆祖宏 刘全俊 潘品良 译

10.1 引言

10.2 微阵列数据库的分析模块

10.3 微阵列数据分析中的噪声采样

10.4 数据共享和查询

10.5 微阵列芯片实验室信息管理系统

10.6 GeneDirector自定义

10.7 总结

参考文献

11 用LFC模型从芯片数据中鉴定差异表达基因 仇华吉 李娜 译

11.1 引言

11.2 将LFC模型应用于实验数据集

11.3 结论

参考文献

12 应用50mer寡核苷酸芯片分析线虫基因表达 高志贤 张蕾 刘楠 译 陈忠斌 校

12.1 引言

12.2 结果

12.3 讨论

12.4 方法

致谢

参考文献

13 生物芯片技术检测大鼠体内药物诱导氧化酶P450 mRNA及其他药物代谢相关基因表达水平：在药物筛选与开发中的应用 马卓娅 汤华 译 陈忠斌 校

13.1 引言

13.2 材料和方法

13.3 结果

13.4 讨论

参考文献

致谢

14 寡核苷酸芯片技术在突变分析中的开发与应用 文思远 王升启 译

14.1 引言

14.2 寡核苷酸制备

14.3 点样过程

14.4 样品制备

14.5 杂交和洗涤

14.6 芯片扫描和数据分析

致谢

参考文献

15 生物芯片技术比较、统计分析和实验设计 付俊杰 苏震 译

15.1 引言

15.2 芯片基因表达平台

15.3 芯片偏差的统计分析

15.4 偏差来源

15.5 统计学定义

15.6 芯片功效分析

15.7 跨平台数据

15.8 样点形态

15.9 功能质量控制

15.10 芯片质量控制：对照探针

15.11 芯片质量控制：检测探针

15.12 应用CodeLink Mouse UnisetⅠ芯片的生物实验

15.13 公共基因表达数据

15.14 可供搜索的公共基因表达数据库和通用数据格式

15.15 基因表达谱：差减杂交与微阵列芯片

15.16 讨论

参考文献

16 INFINITITM系统：临床实验室的自动化多功能芯片平台 周华蕾 姚站馨 吕茂民 译 章金刚 校

16.1 引言

16.2 BioFilmChipTM微阵列芯片

16.3 INFINITITM分析仪

16.4 QmaticTM操作软件

16.5 IntellipacTM试剂管理模块

16.6 INFINITITM系统的应用实例：实验过程及结果分析

16.7 结论

致谢

参考文献

1 RNA的分离

附录Ⅰ 高志贤 张蕾 刘楠 译 陈忠斌 校

2 荧光标记靶基因

3 分光光度法定量检测Cydye标记的靶标

4 用Amersham GENⅢ Microarrayer在氨基硅烷玻片上点制微阵列芯片

5 芯片手工杂交操作程序

6 芯片扫描

附录Ⅱ 高志贤 张蕾 刘楠 译 陈忠斌 校

1 寡核苷酸探针与扩增子探针

2 芯片表面