第一章 Julia语言使用说明

第一节 Julia语言简介

第二节 Julia语言基础

第二章 系谱数据处理方法

第一节 近交系数与亲缘系数

第二节 分子血缘相关矩阵及其逆矩阵计算

第三节 计算实例

第三章 动物遗传育种中的数据模拟

第一节 随机数和随机变量的产生

第二节 误差计算

第三节 使用Julia语言模拟数据

第四节 计算实例

第五节 基因组模拟软件XSim

第四章 线性模型的建立和求解

第一节 单因子模型

第二节 二因子模型

第三节 建立Henderson混合模型方程组

第五章 线性模型的扩展

第一节 有重复记录的动物模型

第二节 母体效应模型

第六章 多性状模型

第一节 多性状模型

第二节 Julia语言实现多性状模型

第三节 带有缺失数据的多性状模型

第七章 分子标记和多基因效应单性状模型

第一节 标记辅助选择

第二节 混合模型方程组的储存技术

第三节 Julia语言示例

第八章 MCMC算法

第一节 贝叶斯统计

第二节 Julia语言的实现

第三节 贝叶斯统计在多元线性模型中的应用

第四节 贝叶斯统计示例

第五节 多性状模型的Gibbs抽样

第六节 思考题解答

第九章 全基因组统计分析

第一节 基于Haseman-Elston回归的全基因组连锁分析

第二节 多元混合线性模型

第三节 贝叶斯GWAS

第四节 单步全基因组分析方法

第五节 GBLUP的准确性

第六节 Julia语言示例

第十章 附录

第一节 线性模型简介

第二节 基于系谱的混合线性模型

第三节 预测SNP效应的固定效应模型

第四节 结合有基因型和无基因型家畜数据

第五节 贝叶斯GWAS基础

第六节 统计基因组学基础