执行摘要

建议

建议的理由

生物学的首要地位

不可预测性

未来前景

1 领域的性质

引言

数学与生物学的交叉

近年来有什么变化？

计算生物学问题困难的原因是什么？

数学与生物科学成功互动的常见因素

为改善两个领域的利益协作打好基础

本报告的结构

参考文献

2 历史上的成功

种群生物学的开端

通过同源性推断基因功能

种群进化过程

建模

医学和生物学成像

总结

参考文献

3 了解分子

引言

数学-生物学关系

分子的数学应用领域

序列分析

结构分析

动力学

相互作用

未来方向

参考文献

4 了解细胞

引言

这些问题的范例

细胞结构

细胞网络及其功能的发现

从网络到细胞功能

从细胞到组织

数据整合

生物学方面的考虑

未来方向

参考文献

5 了解生物体

心脏生理学

循环生理学

呼吸生理学

信息、处理

内分泌生理学

形态发生和模式生成

运动

癌症

针对靶向肿瘤细胞的治疗输送

药物作用的机制

细胞群体的生长和分化

抗性的发展

HIV-1感染的体内动力学

未来方向

参考文献

6 了解种群

种群遗传学

种群的生态方面

生态学与进化论的综合

参考文献

7 了解群落和生态系统

计算

未来方向

参考文献

8 横切主题

“小n，大P”问题

发现基因表达数据中的模式

有监督学习

无监督学习

有序系统的分析

隐马尔可夫模型在DNA、RNA和蛋白质序列分析中的应用

序列谱隐马尔可夫模型

基因发现中的隐马尔可夫模型

蒙特卡罗方法在计算生物学中的应用

模体发现中的吉布斯采样

调控网络的推断

蛋白质构象采样

目前引入的数学主题的经验教训

低级数据的处理

结束语

参考文献