第一卷　序例上

第二卷　序例下

第三卷　百病主治药上

第四卷　百病主治药下

第五卷　水部二类

水一（天水类一十三种）

水二（地水类三十种）

第六卷　火部一类

火一（凡一十一种）

第七卷　土部一类

土一（凡六十一种）

第八卷　金石部五类

金石一（金类二十八种）

石二（玉类一十四种）

第九卷 石三（石类上三十二种）

第十卷　石四（石类下四十种）

第十一卷　石五（卤石类二十种）

附录二十七种

第十二卷　草部一十一类

草一（山草类上三十一种）

第十三卷

草二（山草类下三十九种）

第十四卷

草三（芳草类五十六种）

第十五卷

草四（隰草类上五十三种）

第十六卷

草五（隰草类下七十三种）

草六（毒草类四十七种）

第十七卷

第十八卷

草七（蔓草类七十三种）

附录一十九种

第十九卷

草八（水草类二十二种）

第二十卷

草九（石草类一十九种）

第二十一卷

草十（苔类一十六种）

草十一（杂草类九种、有名未用一百五十三种）

第二十二卷　谷部四类

谷一（麻麦稻类一十二种）

谷二（稷粟类一十八种）

第二十三卷

第二十四卷

谷三（菽豆类一十四种）

第二十五卷

谷四（造酿类二十九种）

第二十六卷　菜部五类

菜一（荤辛类三十二种）

第二十七卷

菜二（柔滑类四十一种）

第二十八卷

菜三（瓜菜类一十一种）

菜四（水菜类六种）

菜五（芝栭类一十五种）

第二十九卷　果部六类

果一（五果类一十一种）

果二（山果类三十四种）

第三十卷

第三十一卷

果三（夷果类三十一种）

第三十二卷

果四（味类一十三种）

第三十三卷

果五（瓜类九种）

果六（水果类六种）

附录二十三种

第三十四卷　木部六类

木一（香木类三十五种）

第三十五卷

木二（乔木类五十二种）

木三（灌木类五十种又一）

第三十六卷

第三十七卷

木四（寓木类一十二种）

木五（苞木类四种）

木六（杂木类七种）

附录十九种

第三十八卷　服器部二类

服器一（服帛类二十五种）

服器二（器物类五十四种）

第三十九卷　虫部四类

虫一（卵生类上二十三种）

第四十卷

虫二（卵生类下二十二种）

第四十一卷

虫三（化生类三十一种）

附录七种

第四十三卷　鳞部四类

鳞一（龙类九种）

鳞二（蛇类一十七种）

第四十四卷

鳞三（鱼类三十一种）

鳞四（无鳞鱼类二十八种）

第四十五卷　介部二类

介一（龟鳖类一十七种）

第四十六卷

介二（蚌蛤类二十九种）

第四十七卷　禽部四类

禽一（水禽类二十三种）

第四十八卷

禽二（原禽类二十二种）

禽三（林禽类一十七种）

第四十九卷

第四十二卷

虫四（湿生类二十三种）

禽四（山禽类一十三种）

第五十卷　兽部四类

兽一（畜类二十八种）

第五十一卷

兽二（兽类三十八种）

兽三（鼠类一十二种）

兽四（寓类怪类共八种）

第五十二卷

人部一类

人一（凡三十五种）