第1章 绪论

1.1研究背景

1.2本书结构

参考文献

第2章 蛋白质的折叠速率

2.1蛋白质的折叠速率研究进展

2.1.1基于蛋白质三级结构的预测方法

2.1.2基于蛋白质二级结构的预测方法

2.1.3基于蛋白质一级结构的预测方法

2.2氨基酸片段的极性对相应肽链折叠速率的影响

2.2.1材料准备

2.2.2统计分析

2.2.3研究结果

2.2.4讨论

2.3 mRNA对蛋白质结构的影响

2.3.1 mRNA对蛋白质结构影响的必然性分析

2.3.2数据获得方法

2.3.3数据分析方法

参考文献

第3章 基因序列信息参数对蛋白质折叠速率的影响

3.1全β类蛋白质mRNA序列的GC含量对蛋白质折叠速率的影响

3.1.1材料

3.1.2统计分析

3.1.3结果

3.1.4讨论

3.2核苷酸统计关联

3.3 mRNA序列信息参数对蛋白质折叠速率的影响

3.3.1材料

3.3.2统计分析

3.3.3结果与讨论

参考文献

第4章 回文结构

4.1回文结构及其生物学意义

4.1.1回文结构的意义

4.1.2回文结构的获得

4.2 SARS病毒全序列回文结构的统计分析

4.2.1材料的选取

4.2.2研究方法

4.2.3结果

4.2.4讨论

4.3艾滋病病毒全序列回文结构的统计分析

4.3.1回文结构的统计

4.3.2结果与讨论

4.3.3结论

参考文献

第5章 回文结构对蛋白质折叠速率的影响

5.1病毒mRNA序列中回文结构对蛋白质折叠速率的影响

5.1.1材料

5.1.2统计分析

5.1.3结果

5.1.4讨论

5.2全β类蛋白质相应mRNA序列中的回文结构对蛋白质折叠速率的影响

5.2.1材料

5.2.2统计分析

5.2.3结果

5.2.4讨论

5.3 mRNA序列中回文结构对蛋白质折叠速率的影响

5.3.1数据

5.3.2统计分析

5.3.3结果

5.3.4讨论

参考文献

第6章 同义密码子的使用偏性

6.1 mRNA同义密码子的使用偏性

6.1.1同义密码子使用偏性

6.1.2同义密码子使用偏性分析方法

6.2大肠杆菌核蛋白的同义密码子使用偏性对肽链折叠速率的影响

6.2.1材料

6.2.2统计分析

6.2.3结果

6.2.4讨论

6.3枯草芽孢杆菌核蛋白同义密码子使用偏性对肽链折叠速率的影响

6.3.1材料

6.3.2统计分析

6.3.3结果

6.3.4讨论

6.4人类核蛋白同义密码子使用偏性对肽链折叠速率的影响

6.4.1材料

6.4.2结果

6.4.3讨论

6.5同义密码子的使用偏性对蛋白质折叠速率的影响

6.5.1材料

6.5.2统计分析

6.5.3结果

6.5.4讨论

参考文献

第7章mRNA二级结构及其对蛋白质折叠速率的影响

7.1 RNA二级结构

7.1.1 RNA二级结构预测算法

7.1.2 RNA二级结构的元件

7.1.3二级结构的图形表示方法

7.1.4 RNA二级结构特征量提取

7.2 A型流感病毒同义密码子的使用偏性对mRNA二级结构的影响

7.2.1材料

7.2.2分析方法

7.2.3结果

7.2.4讨论

7.3冠状病毒同义密码子的使用偏性对mRNA二级结构的影响

7.3.1材料

7.3.2统计分析

7.3.3结果

7.3.4 讨论

7.4 mRNA的二级结构对蛋白质折叠速率的影响

7.4.1数据集

7.4.2分析方法

7.4.3结果

7.4.4讨论

参考文献

第8章 总结与展望

索引